BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= BA0AB032A11LP1|AL429506
(842 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
3x_Contig1428 1259 0.0
3x_Contig550 293 3e-79
3x_Contig1358 143 7e-34
3x_Contig1693 133 6e-31
3x_Contig1462 121 2e-27
3x_Contig1226 113 6e-25
3x_Contig1063 107 4e-23
3x_Contig1572 103 6e-22
3x_Contig1722 100 9e-21
>3x_Contig1428
Length = 9146
Score = 1259 bits (635), Expect = 0.0
Identities = 644/647 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 196 agttgttgttctgtttgttattaattgagtagttactgttggaattacttgttgtggagg 255
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 65 aaccggtcgtaccattactatttccagtgagtattacatcattaactgaaggattggcct 124
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Query: 376 tttgattcatcatgggtgccacttggtgatttatcagtgggggggctttttgttgctgat 435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 185 tttgattcatcatgggtgccacttggtgatttatcagtgggggggctttttgttgctgat 244
Query: 436 gtggctgaatgtgatgattttggaattgtaattgatgatgatgatgatgttgttgttgtt 495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 245 gtggctgaatgtgatgattttggaattgtaattgatgatgatgatgatgttgttgttgtt 304
Query: 496 gttgttgttgttgttgttgctgttgatgttgtagttgtagatgctgttactgtaattgct 555
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
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Query: 556 gttcatgttgttgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgtt 615
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Sbjct: 365 gttcatgttgttgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgtt 424
Query: 616 gttgttgctgttgttgctgttgctgttgctgaagaattatattcgaatgcagctgttggc 675
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Sbjct: 425 gttgttgctgttgttgctgttgctgttgctgaagaattatattcgaatgcagctgttggc 484
Query: 676 ccagattcccggacaggtgttgctgagcaacgttattccttggtgtagcatatgcgaccc 735
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Query: 736 ttaactgtcttccttgaaattgcacaccattcatttcaattaatgcatttcttctttcgg 795
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Query: 796 tttcattagcaaaccttacgaaaccaaagcagcgcgacgcaccggtg 842
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 605 tttcattagcaaaccttacgaaaccaaagcagcgcgacgcaccggtg 651
>3x_Contig550
Length = 2221
Score = 293 bits (148), Expect = 3e-79
Identities = 241/272 (88%)
Strand = Plus / Plus
Query: 375 gtttgattcatcatgggtgccacttggtgatttatcagtgggggggctttttgttgctga 434
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Sbjct: 1754 gtttgcttcctcctgggtgccccttggtgctttctccgtgggggggctttttgttgctgc 1813
Query: 435 tgtggctgaatgtgatgattttggaattgtaattgatgatgatgatgatgttgttgttgt 494
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Sbjct: 1814 tgtggctgcctgtgctgcttttggccttgtccttgctgctgctgctgctgttgttgttgt 1873
Query: 495 tgttgttgttgttgttgttgctgttgatgttgtagttgtagatgctgttactgtaattgc 554
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Sbjct: 1874 tgttgttgttgttgttgttgctgttgctgttgtcgttgtcgctgctgtccctgtccttgg 1933
Query: 555 tgttcatgttgttgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgt 614
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Sbjct: 1934 tgttcctgttgttgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgt 1993
Query: 615 tgttgttgctgttgttgctgttgctgttgctg 646
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1994 tgttgttgctgttgttgctgttgctgttgctg 2025
Score = 287 bits (145), Expect = 2e-77
Identities = 235/265 (88%)
Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 1380 gaatctttacatcagtgatggtaccaaaaggtttaaaaagctcaaaaagctgtagctcat 1439
Query: 61 tgatatttggattcaaaccaccaacaaatacagtggtagaagagaccccagcgttcatcg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1440 tgatatttggattcaaaccaccaacaaatacagtggtagaagagaccccagcgttcatcg 1499
Query: 121 cattattgtttactgttgtggttgaggaggaagttggtgaatacacagacaacccgttgg 180
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Sbjct: 1500 cattattgtttactgttgtggttgcggcggccgttggtgcctcccccgcccccccgttgg 1559
Query: 181 ggttattaacatcgaagttgttgttctgtttgttattaattgagtagttactgttggaat 240
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Sbjct: 1560 ggttcttcccctcgccgttgttgttctgtttgttcttccttgcgtcgttcctgttggcct 1619
Query: 241 tacttgttgtggaggaaccggtcgt 265
| |||||||||| || ||||||||
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>3x_Contig1358
Length = 7912
Score = 143 bits (72), Expect = 7e-34
Identities = 123/140 (87%)
Strand = Plus / Minus
Query: 504 tgttgttgttgctgttgatgttgtagttgtagatgctgttactgtaattgctgttcatgt 563
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Query: 564 tgttgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgc 623
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Query: 624 tgttgttgctgttgctgttg 643
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Sbjct: 2863 tgttgttgctgctgttgttg 2844
Score = 131 bits (66), Expect = 2e-30
Identities = 135/158 (85%)
Strand = Plus / Minus
Query: 483 tgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgttgatgttgtagttgtagatgctgt 542
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Sbjct: 2983 tgttgctgttgctgttgttgctgttgctgttgctgttgttgctgttgttgctgttgctgt 2924
Query: 543 tactgtaattgctgttcatgttgttgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgt 602
| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 603 tgttgttgttgttgttgttgctgttgttgctgttgctg 640
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Sbjct: 2863 tgttgttgctgctgttgttgttgttgctgttgttgctg 2826
Score = 123 bits (62), Expect = 6e-28
Identities = 134/158 (84%)
Strand = Plus / Minus
Query: 489 tgttgttgttgttgttgttgttgttgctgttgatgttgtagttgtagatgctgttactgt 548
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Sbjct: 2983 tgttgctgttgctgttgttgctgttgctgttgctgttgttgctgttgttgctgttgctgt 2924
Query: 549 aattgctgttcatgttgttgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgt 608
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Sbjct: 2923 tgttgttgttgctgttgttgttgttgttgttgctgttgttgttgttgttgttgttgttgc 2864
Query: 609 tgttgttgttgttgctgttgttgctgttgctgttgctg 646
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Sbjct: 2863 tgttgttgctgctgttgttgttgttgctgttgttgctg 2826
Score = 121 bits (61), Expect = 2e-27
Identities = 132/155 (85%), Gaps = 3/155 (1%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 546 tgtaattgctgttcatgttgttgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgt 605
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Sbjct: 2905 tgttgttgttgttgctgttgttgttgttgttgttgttgttgctgttgttgctgctgttgt 2846
Query: 606 tgttgttgttgttgttgctgttgttgctgttgctg 640
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Sbjct: 2845 tgttgttgctgttgttgctgctgttgttgttgctg 2811
Score = 113 bits (57), Expect = 6e-25
Identities = 135/161 (83%)
Strand = Plus / Minus
Query: 486 tgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgttgatgttgtagttgtagatgctgttac 545
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Sbjct: 2971 tgttgttgctgttgctgttgctgttgttgctgttgttgctgttgctgttgttgttgttgc 2912
Query: 546 tgtaattgctgttcatgttgttgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgt 605
||| ||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct: 2911 tgttgttgttgttgttgttgctgttgttgttgttgttgttgttgttgctgttgttgctgc 2852
Query: 606 tgttgttgttgttgttgctgttgttgctgttgctgttgctg 646
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Sbjct: 2851 tgttgttgttgttgctgttgttgctgctgttgttgttgctg 2811
>3x_Contig1693
Length = 15531
Score = 133 bits (67), Expect = 6e-31
Identities = 76/79 (96%)
Strand = Plus / Minus
Query: 564 tgttgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgc 623
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Query: 624 tgttgttgctgttgctgtt 642
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Sbjct: 8876 tgttgctgctgttgctgtt 8858
Score = 119 bits (60), Expect = 1e-26
Identities = 72/76 (94%)
Strand = Plus / Minus
Query: 561 tgttgttgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgt 620
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Sbjct: 8933 tgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgt 8874
Query: 621 tgctgttgttgctgtt 636
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Sbjct: 8873 tgctgctgttgctgtt 8858
Score = 119 bits (60), Expect = 1e-26
Identities = 66/68 (97%)
Strand = Plus / Minus
Query: 579 tgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgttgttgctgttgc 638
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Sbjct: 8936 tgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgc 8877
Query: 639 tgttgctg 646
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Sbjct: 8876 tgttgctg 8869
Score = 111 bits (56), Expect = 2e-24
Identities = 70/74 (94%), Gaps = 3/74 (4%)
Strand = Plus / Minus
Query: 576 tgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgttgttgctgt 635
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Sbjct: 8933 tgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgt 8874
Query: 636 tg---ctgttgctg 646
|| |||||||||
Sbjct: 8873 tgctgctgttgctg 8860
>3x_Contig1462
Length = 8247
Score = 121 bits (61), Expect = 2e-27
Identities = 73/77 (94%)
Strand = Plus / Minus
Query: 570 tgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgttgt 629
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Query: 630 tgctgttgctgttgctg 646
||||| ||||| |||||
Sbjct: 5461 tgctgctgctgctgctg 5445
Score = 121 bits (61), Expect = 2e-27
Identities = 73/77 (94%)
Strand = Plus / Minus
Query: 570 tgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgttgt 629
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
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Query: 630 tgctgttgctgttgctg 646
||||| ||||| |||||
Sbjct: 5458 tgctgctgctgctgctg 5442
Score = 109 bits (55), Expect = 9e-24
Identities = 67/71 (94%)
Strand = Plus / Minus
Query: 576 tgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgttgttgctgt 635
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Query: 636 tgctgttgctg 646
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Sbjct: 5446 tgctgctgctg 5436
Score = 105 bits (53), Expect = 1e-22
Identities = 71/77 (92%)
Strand = Plus / Minus
Query: 570 tgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgttgt 629
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Sbjct: 5515 tgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgc 5456
Query: 630 tgctgttgctgttgctg 646
||||| ||||| |||||
Sbjct: 5455 tgctgctgctgctgctg 5439
Score = 105 bits (53), Expect = 1e-22
Identities = 71/77 (92%)
Strand = Plus / Minus
Query: 570 tgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgttgt 629
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 5524 tgctgctgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgt 5465
Query: 630 tgctgttgctgttgctg 646
|| || ||||| |||||
Sbjct: 5464 tgttgctgctgctgctg 5448
Score = 105 bits (53), Expect = 1e-22
Identities = 71/77 (92%)
Strand = Plus / Minus
Query: 570 tgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgttgt 629
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 5527 tgctgctgctgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgt 5468
Query: 630 tgctgttgctgttgctg 646
|| |||||||| |||||
Sbjct: 5467 tgttgttgctgctgctg 5451
Score = 103 bits (52), Expect = 6e-22
Identities = 73/80 (91%)
Strand = Plus / Minus
Query: 567 tgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgt 626
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 5512 tgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgctgc 5453
Query: 627 tgttgctgttgctgttgctg 646
|| ||||| ||||| |||||
Sbjct: 5452 tgctgctgctgctgctgctg 5433
Score = 99.6 bits (50), Expect = 9e-21
Identities = 74/82 (90%)
Strand = Plus / Minus
Query: 564 tgttgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgc 623
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct: 5512 tgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgctgc 5453
Query: 624 tgttgttgctgttgctgttgct 645
|| || ||||| ||||| ||||
Sbjct: 5452 tgctgctgctgctgctgctgct 5431
>3x_Contig1226
Length = 5066
Score = 113 bits (57), Expect = 6e-25
Identities = 72/77 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 561 tgttgttgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgt 620
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4891 tgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgt 4950
Query: 621 tgctgttgttgctgttg 637
|| ||| | ||||||||
Sbjct: 4951 tggtgtcgctgctgttg 4967
Score = 109 bits (55), Expect = 9e-24
Identities = 70/75 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 566 ttgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctg 625
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 4887 ttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttg 4946
Query: 626 ttgttgctgttgctg 640
|||||| ||| ||||
Sbjct: 4947 ttgttggtgtcgctg 4961
Score = 109 bits (55), Expect = 9e-24
Identities = 67/71 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 576 tgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgttgttgctgt 635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct: 4891 tgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgt 4950
Query: 636 tgctgttgctg 646
|| ||| ||||
Sbjct: 4951 tggtgtcgctg 4961
Score = 107 bits (54), Expect = 4e-23
Identities = 63/66 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 563 ttgttgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttg 622
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4887 ttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttg 4946
Query: 623 ctgttg 628
|||||
Sbjct: 4947 ttgttg 4952
Score = 107 bits (54), Expect = 4e-23
Identities = 63/66 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 578 ttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgttgttgctgttg 637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct: 4887 ttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttg 4946
Query: 638 ctgttg 643
|||||
Sbjct: 4947 ttgttg 4952
Score = 107 bits (54), Expect = 4e-23
Identities = 60/62 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 561 tgttgttgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgt 620
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4888 tgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgt 4947
Query: 621 tg 622
||
Sbjct: 4948 tg 4949
>3x_Contig1063
Length = 5012
Score = 107 bits (54), Expect = 4e-23
Identities = 69/74 (93%)
Strand = Plus / Minus
Query: 562 gttgttgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgtt 621
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Sbjct: 212 gttgtggtggctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgatgttgtg 153
Query: 622 gctgttgttgctgt 635
||||||||||||||
Sbjct: 152 gctgttgttgctgt 139
>3x_Contig1572
Length = 12810
Score = 103 bits (52), Expect = 6e-22
Identities = 136/164 (82%)
Strand = Plus / Minus
Query: 483 tgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgttgatgttgtagttgtagatgctgt 542
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Sbjct: 11529 tgttgctgctgttgttgatgttgatgttgttgatgttgatgttgttgatgttgatgttgt 11470
Query: 543 tactgtaattgctgttcatgttgttgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgt 602
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Sbjct: 11469 tgatgttgttgatgttgttgatgttgttgatgttgttgatgttgttgatgttgttgatgt 11410
Query: 603 tgttgttgttgttgttgttgctgttgttgctgttgctgttgctg 646
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Sbjct: 11409 tgttgatgttgttgatgttgctgatgctgctgctgctgctgctg 11366
Score = 101 bits (51), Expect = 2e-21
Identities = 129/155 (83%)
Strand = Plus / Minus
Query: 492 tgttgttgttgttgttgttgttgctgttgatgttgtagttgtagatgctgttactgtaat 551
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Sbjct: 11535 tgttgctgttgctgctgttgttgatgttgatgttgttgatgttgatgttgttgatgttga 11476
Query: 552 tgctgttcatgttgttgttgctgctgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgt 611
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Sbjct: 11475 tgttgttgatgttgttgatgttgttgatgttgttgatgttgttgatgttgttgatgttgt 11416
Query: 612 tgttgttgttgctgttgttgctgttgctgttgctg 646
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Sbjct: 11415 tgatgttgttgatgttgttgatgttgctgatgctg 11381
>3x_Contig1722
Length = 17718
Score = 99.6 bits (50), Expect = 9e-21
Identities = 53/54 (98%)
Strand = Plus / Minus
Query: 577 gttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgctgttgtt 630
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Sbjct: 9975 gttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgttgtt 9922
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
Posted date: Nov 27, 2002 12:23 PM
Number of letters in database: 10,358,551
Number of sequences in database: 1807
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 14,560
Number of Sequences: 1807
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Number of successful extensions: 3070
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length of query: 842
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effective length of database: 10,329,639
effective search space: 8532281814
effective search space used: 8532281814
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 50 (99.6 bits)